Pour protéger une seule partie de votre site, vous publiez votre fichier dans un répertoire. Ici j'ai voulu protéger mon sous-dossier nommé SKINS qui se trouve dans un dossier nommé TEST  J'ai donc publier mon fichier dans ce sous-dossier (test/skins) et je l'ai renommé .htaccess

Le code sur mon fichier change aussi ! N'oubliez pas d'indiquer le dossier à protéger (ici bas en jaune) :

RewriteEngine On 
RewriteCond %{HTTP_REFERER} !^$ 
RewriteCond %{HTTP_REFERER} !^http://www.monsite/test/skins/.*$ [NC] 
ReWriteRule .*\.(gif|png|jpe?g)$ nothotlink.jpg [L]

J'ai seulement protégé ce dossier donc mes images se retrouvant dans le dossier skins ne pourront pas être hotlinkées!  Je vous ai fait un screenshot à propos du chmod (un clic droit sur le fichier et je choisis attributs) :